Anglikan Protestan Kilisesi 1838 yılında küçük bir şapel olarak o yıllardaki topluluk tarafından ibadet için kullanılmaya başlanmıştır. Bu küçük şapel 1868 yılında Abdülaziz Han’ın fermanı ile bugünkü duruma gelmiştir.
Yapı, klasik haçvari plan üzerine kurulmuş, önemli finansörlerinden Rees Ailesi’nin kökenine uyarak çatı malzemesi (slate) Galler Bölgesi’nden ithal edilmiştir. Kilisenin içindeki orgun üzerinde bulunan mini plakanın yazısına göre, yine aynı aile (T.Bowen Rees & Mrs. Rees) Birinci Dünya Savaşı’nda ailelerine zarar gelmediği için duydukları şükranı, orgu finanse edip 1922’de bağışlayarak belirtmişlerdir (yine İngiltere’den ithal ve Buca’ya gelen demiryolu ile nakliye edildiğini varsayıyoruz). Kilise yayını ‘Candlesticks’ yaz 56 makalesinde Başpapazın Buca kilise ziyareti sırasında orgun Alsancak St.John kilisesine nakli tartışılmış fakat son karar belli ki verilememiş. Bugünkü renkli vitraylar orijinal olmayıp orijinalleri 1964 Kasım’ında Alsancak İngiliz Kilisesi’ne nakledilmiştir.
Cemaat yokluğu ve çeşitli nedenlerden dolayı Kilise 1965 senesinde Buca Belediyesi’ne devredildikten sonra bir süre evlendirme dairesi ve farklı amaçlar için hizmet vermiştir. 1991 yılında Kültür Sanat Merkezi olarak tekrar organize edilmiş ve zaman içerisinde kilise bahçesindeki mezarlıkların ön kısmı zarar görmüştür.
İzmirliler Derneği’nin desteği ve katkılarıyla bu yapı İzmir’i de kapsayan inanç turizminin yeni odak noktası haline gelmiştir. Kilisenin İncil’de adı geçen ve hepsi Ege bölgesinde olan yedi kilise şehirlerinden biri olması ile (Smyrna), şimdiye kadar birçok yabancı turist grubunun ayinlerine ev sahipliği yapmıştır.
İzmir Bağımsız Protestan Kilisesi (Baptistler) olarak Buca Belediyesi’nin girişimleri sonucunda bize tahsis edilen bu kilisenin 8tamir ve bakımını üstlenerek Nisan 2001 tarihinden bu yana bu tarihi kilisede ibadetimizi sürdürmekteyiz.